主要区别 | 无公害 | 绿色 | 有机 |
申报主体(生产者类型) | 农户和企业、事业单位 | 企业、龙头企业带动农户 | 企业、农场、农户 |
产品结构和类别 | 初加工和未加工的食用农产品 | 70%为加工产品(食品及其生产资料)，30%为初级农产品 | 初级农产品为主（食用农产品、纤维材料、药材及药用材料） |
生产资料要求 | 允许使用大部分中低毒农药 | 限量限时限品种用，一种药一个生育期只能用一次 | 不允许使用任何化学合成物质 |
运行方式 | 政府运作 | 企业运作 | 企业、农场、农户 |
特征 | 安全、环保(重安全、需环保) | 安全、环保(两者并重) | 重环保，强调特殊农产安全 |
产生背景 | 20世纪初，农产品质量安全屡屡出现问题 | 1990年农产品总量供应问题已解决，质量需提高的情况下 | 60年代石油工业的发展引发了环境污染问题 |
标准的性质 | 产品、环境标准和生产资料使用准则为强制性国家及行业标准，生产操作规程为推荐性国家、行业标准 | 推荐性农业行业标准 | 以国际有机农业运动联盟（IFOAM）的基本标准为代表的民间组织标准和各国政府推荐性标准并存 |
标准水平 | 略高或等同于国内普通食品标准 | AA级绿色食品认证准则等效采用IFOAM和欧盟的有关标准的原则；A级一般高于国内同类标准的水平 | 强调生产过程的自然与回归，与传统所指的检测标准无可比性 |
标志与认证机构不同 | 国家、地方、部门有不同的标志。(农业部统一的中国绿色食品发展中心和省里负责基地认定，目前省里和农业农产品质量安全中心负责产品认证) | 统一的绿色食品名称及商标标志，在中国内地、香港和日本注册使用。由中国绿色食品发展中心统一认定 | 全球范围内无统一标志，不同的国家，不同的认证机构，其标识各不相同。农业部成立了中绿华夏有机认证中心 |